38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0020 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 173 aa  350  4e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  75.86 
 
 		 174 aa  273  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  51.43 
 
 		 175 aa  191  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  52.87 
 
 		 174 aa  191  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  51.93 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  51.93 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  58.28 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  50.28 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  61.18 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  52.02 
 
 		 174 aa  183  8e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  48 
 
 		 175 aa  182  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  49.72 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  45.83 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  45.13 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  50.3 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  47.22 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  50.99 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  43.98 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  43.98 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  47.62 
 
 		 193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  47.13 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  42.41 
 
 		 193 aa  157  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  48.81 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  45.6 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  40.31 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  45.03 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  43.51 
 
 		 196 aa  136  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  39.1 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  36.27 
 
 		 305 aa  108  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  35.68 
 
 		 301 aa  103  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  33.97 
 
 		 297 aa  100  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.95 
 
 		 300 aa  99.4  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.95 
 
 		 300 aa  99.4  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  34.18 
 
 		 304 aa  98.2  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2153  ribosomal protein L18  29.03 
 
 		 116 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438386  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  34.45 
 
 		 121 aa  42.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0735  ribosomal protein L18  33.33 
 
 		 115 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0002396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0474  50S ribosomal protein L18  35.21 
 
 		 117 aa  40.8  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>