41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0173 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  78.05 
 
 		 205 aa  345  3e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  78.54 
 
 		 205 aa  343  8e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  76.59 
 
 		 205 aa  338  4e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  58.13 
 
 		 207 aa  244  4.9999999999999997e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  56.48 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  54.17 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  54.17 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  54.17 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  53.4 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  53.12 
 
 		 193 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  53.12 
 
 		 196 aa  203  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  55.21 
 
 		 194 aa  201  6e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  47.96 
 
 		 186 aa  192  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  49.22 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  48.19 
 
 		 182 aa  185  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  47.15 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  56.58 
 
 		 175 aa  185  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  53.25 
 
 		 174 aa  178  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  53.95 
 
 		 175 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  56.33 
 
 		 165 aa  175  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  50.3 
 
 		 173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  53.95 
 
 		 175 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  46.6 
 
 		 174 aa  167  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  44.39 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  48.39 
 
 		 174 aa  158  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  52.63 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  45.45 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  34.18 
 
 		 304 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  31.43 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  35.21 
 
 		 297 aa  108  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  30.38 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.63 
 
 		 300 aa  97.1  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.63 
 
 		 300 aa  97.1  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  33.61 
 
 		 127 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  34.65 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  34.65 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  33.01 
 
 		 123 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  32.52 
 
 		 122 aa  42.4  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  36.05 
 
 		 120 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0267  ribosomal protein L18  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>