More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0676 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  73.95 
 
 		 119 aa  190  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0095  50S ribosomal protein L18  75.63 
 
 		 119 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0507743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2241  50S ribosomal protein L18  71.67 
 
 		 120 aa  150  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  54.92 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 114 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  52.54 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  54.46 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  54.62 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  52.99 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1362  ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  54.13 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 120 aa  117  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  53.72 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  49.18 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  52.03 
 
 		 118 aa  114  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  51.61 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  57.58 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  49.11 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  52.17 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  50.85 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 119 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  53.15 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  51.67 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  51.26 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0800  50S ribosomal protein L18  44.07 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00718139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  51.33 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  50.85 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  46.28 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  46.22 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  50.85 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  50.85 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  51.24 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  52.21 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  48.74 
 
 		 116 aa  107  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  53.47 
 
 		 116 aa  106  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  47.06 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  50 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 123 aa  105  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  52.59 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  49.59 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  43.8 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  45.9 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  48.72 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  52.14 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  54.9 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  57.01 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>