More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0410 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0410  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
119 aa  233  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0385  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
119 aa  233  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0735  ribosomal protein L18  54.62 
 
 
115 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0002396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06410  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 
116 aa  120  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00978537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5063  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136187  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0505  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 
116 aa  118  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000721211  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0842  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 
117 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0500  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 
116 aa  118  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000674494  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  60.82 
 
 
121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0853  50S ribosomal protein L18  57.84 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.069304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09010  50S ribosomal protein L18  57.84 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00133573  normal  0.174484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3893  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000259754  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0295  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000164906  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  56.7 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0772  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 
117 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.638388  normal  0.012276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0642  ribosomal protein L18  58.95 
 
 
116 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00442268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4532  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 
116 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00621491  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0442  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 
116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110034  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  51.69 
 
 
125 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0470  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 
116 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000372207  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0503  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 
116 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824638  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0500  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 
116 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000118078  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4733  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 
116 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000341621  normal  0.608579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3322  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000880137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0437  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 
116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0352057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3933  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0343  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 
117 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0251755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0513  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 
117 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00333829  unclonable  0.0000000000149151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0335  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304847  unclonable  0.0000000454999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0975  50S ribosomal protein L18  53.92 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000749489  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 
121 aa  110  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2356  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
117 aa  110  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 
121 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  50.41 
 
 
121 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  59.79 
 
 
122 aa  110  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  59.79 
 
 
122 aa  110  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  53.61 
 
 
121 aa  110  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  55.88 
 
 
120 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3003  50S ribosomal protein L18  48.33 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0984872  normal  0.0535953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2934  50S ribosomal protein L18  48.33 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.431392  hitchhiker  0.000000945815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3281  50S ribosomal protein L18  48.33 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000101647  hitchhiker  0.0000625516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3301  50S ribosomal protein L18  47.5 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148876  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  51.61 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2616  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0292  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000486203  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3760  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00916301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3463  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00117262  normal  0.0353993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3052  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00599217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1940  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143893  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2743  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00333215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3788  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0343  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340572  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0283  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0906703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0265  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00184574  hitchhiker  0.00751382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3427  50S ribosomal protein L18  48.36 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.190409 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0364  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000939296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3494  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.463785  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3153  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0233073  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3730  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000891962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  51.28 
 
 
120 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04504  50S ribosomal protein L18  47.06 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2823  50S ribosomal protein L18  46.34 
 
 
121 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0449582  normal  0.246581 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0066  50S ribosomal protein L18  46.22 
 
 
117 aa  105  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  hitchhiker  0.000000000000207264 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0353  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 
117 aa  105  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0474  50S ribosomal protein L18  54.74 
 
 
117 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1838  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 
117 aa  105  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2153  ribosomal protein L18  54.37 
 
 
116 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438386  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0330  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0191995  decreased coverage  0.00330541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1038  50S ribosomal protein L18  47.54 
 
 
121 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219408  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  49.58 
 
 
119 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3628  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 
121 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000201917  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0069  50S ribosomal protein L18  44.54 
 
 
117 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0150705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2308  50S ribosomal protein L18  49.02 
 
 
117 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2308  ribosomal protein L18  47.9 
 
 
117 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000272436  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0311  ribosomal protein L18  45.38 
 
 
117 aa  103  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00282815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  57.73 
 
 
120 aa  103  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  52.53 
 
 
120 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  52.53 
 
 
120 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0617  50S ribosomal protein L18  45.9 
 
 
121 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130788  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  48.31 
 
 
120 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0617  ribosomal protein L18  47.06 
 
 
117 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3163  50S ribosomal protein L18  47.5 
 
 
118 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00625996  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  48.31 
 
 
120 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0421  50S ribosomal protein L18P  47.06 
 
 
117 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0951121  normal  0.234114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
120 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  48.54 
 
 
120 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  47.41 
 
 
120 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  49.15 
 
 
120 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  49.56 
 
 
120 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4260  ribosomal protein L18  54.08 
 
 
116 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000795292  unclonable  0.00000000000239717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1930  ribosomal protein L18  48.74 
 
 
120 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>