More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_432 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  100 
 
 		 121 aa  245  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  99.17 
 
 		 121 aa  243  4e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  99.17 
 
 		 121 aa  243  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  61.79 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  65.66 
 
 		 121 aa  136  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  59.5 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  55.93 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  65 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 120 aa  130  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  59.63 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 117 aa  130  6.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 120 aa  130  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  54.62 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  57.8 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  57.85 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 122 aa  126  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 122 aa  126  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  61.62 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  61.62 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  59.65 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  55.75 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  61.76 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  55.96 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  52.46 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  52.89 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  51.64 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  47.97 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  58.59 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  53.4 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  55.66 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  54.78 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  49.18 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  49.18 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  56.52 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  47.54 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  56.86 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  54.78 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  52.21 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  53.7 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  53.04 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  52.83 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  53.98 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  55.05 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0343  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0251755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0513  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00333829  unclonable  0.0000000000149151 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  51.24 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  54.87 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  50.85 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1031  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295773  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  53.98 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1060  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172408  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  56.6 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>