More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1113 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1113  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
320 aa  647    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.46 
 
 
326 aa  316  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.38 
 
 
323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0770  alcohol dehydrogenase  46.11 
 
 
321 aa  269  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00613196  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0087  alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
345 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.68 
 
 
341 aa  188  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.38 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
333 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
345 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1030  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.57 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0743662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.19 
 
 
348 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.66 
 
 
346 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
346 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
349 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.09 
 
 
367 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.41 
 
 
346 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
352 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
341 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
341 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.86 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 
337 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  31.23 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.45 
 
 
349 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.96 
 
 
325 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  33.94 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.41 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 
344 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.63 
 
 
336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.63 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  29.55 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  27.47 
 
 
338 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
327 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.31 
 
 
340 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.9 
 
 
340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.9 
 
 
340 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.9 
 
 
340 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  30.52 
 
 
338 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  28.82 
 
 
340 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.82 
 
 
340 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.82 
 
 
340 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  28.82 
 
 
340 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
340 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  28.99 
 
 
338 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 
335 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.28 
 
 
337 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.03 
 
 
340 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.41 
 
 
336 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
318 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.06 
 
 
340 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.19 
 
 
352 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
335 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
336 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.2 
 
 
344 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
317 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
330 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.85 
 
 
335 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.52 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
336 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  27.72 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.24 
 
 
373 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 
340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.12 
 
 
310 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.211345  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  28.8 
 
 
352 aa  119  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  27.62 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.62 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  34.48 
 
 
340 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  27.97 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  27.62 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.79 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.46 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  29.64 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  27.62 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  30.74 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  27.93 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  34.48 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.64 
 
 
373 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>