281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3305 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3305  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
423 aa  832    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4720  beta-lactamase domain protein  45.19 
 
 
416 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.209873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0021  beta-lactamase domain protein  36.57 
 
 
422 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0260  beta-lactamase domain-containing protein  35.93 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3639  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 
428 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2888  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 
429 aa  179  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1136  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.4 
 
 
520 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
546 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2899  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
529 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.920708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2046  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily-like  29.41 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.419381  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1639  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.6 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000492712  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  24.66 
 
 
555 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 
554 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  27.7 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  25.4 
 
 
555 aa  77.4  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  25.06 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 
553 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  25.06 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 
558 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
557 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  32.12 
 
 
556 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  22.75 
 
 
558 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 
559 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.13 
 
 
557 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  25.88 
 
 
555 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.7 
 
 
558 aa  70.1  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  24.81 
 
 
558 aa  69.7  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1034  hypothetical protein  21.97 
 
 
519 aa  68.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000166295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  25.97 
 
 
565 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 
556 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  25.91 
 
 
544 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  23.56 
 
 
631 aa  67.8  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2421  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  29.28 
 
 
547 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  27.89 
 
 
557 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  32.12 
 
 
650 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  24.94 
 
 
558 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.868415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  23.41 
 
 
554 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0808  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 
519 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.276491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  22.69 
 
 
590 aa  66.2  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 
557 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 
557 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  25.12 
 
 
560 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 
557 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 
548 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  22.97 
 
 
554 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  25.28 
 
 
556 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  24.34 
 
 
555 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  23.75 
 
 
566 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  22.19 
 
 
618 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 
553 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  25.07 
 
 
558 aa  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 
561 aa  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 
580 aa  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  23.47 
 
 
555 aa  63.2  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  25.71 
 
 
555 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  25.71 
 
 
555 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  24.7 
 
 
558 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  26.87 
 
 
556 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 
556 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 
556 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
561 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 
564 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  23.82 
 
 
561 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  22.3 
 
 
551 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 
555 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1170  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  21.46 
 
 
591 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.811184  hitchhiker  0.000000000000102391 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  22.3 
 
 
551 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  22.77 
 
 
555 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 
556 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 
432 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  24.94 
 
 
558 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.99 
 
 
557 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 
561 aa  60.1  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  22.82 
 
 
556 aa  60.1  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 
555 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 
557 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  24.27 
 
 
551 aa  59.7  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  23.6 
 
 
544 aa  59.7  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  23.29 
 
 
644 aa  59.7  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  22.06 
 
 
551 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
554 aa  59.7  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  28.64 
 
 
485 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
548 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
556 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  24.11 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  23.3 
 
 
556 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  23.3 
 
 
556 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  23.3 
 
 
556 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  24.45 
 
 
555 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  21.64 
 
 
548 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  23.6 
 
 
556 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0649  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 
593 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000403625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2687  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 
591 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
555 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  23.3 
 
 
556 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  23.3 
 
 
556 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 
559 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>