48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1766 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  40.87 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  39.63 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  34.1 
 
 		 238 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  34.68 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  35.68 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  37.9 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  36.56 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  34.09 
 
 		 228 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  36.04 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  39.45 
 
 		 224 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  37.26 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 214 aa  92.8  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  37.95 
 
 		 231 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 215 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  34.84 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 284 aa  85.1  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  37.71 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  24 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  23.24 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  25.54 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  25.41 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  25.41 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  25.54 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  25.54 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  23.62 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  33.16 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  36.76 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  36.04 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 		 232 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>