More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1201 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  62.38 
 
 		 277 aa  265  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  56.54 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  55.2 
 
 		 274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  54.63 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  56.65 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  54.85 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  54.59 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  55.79 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  56.38 
 
 		 204 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  55 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  45.75 
 
 		 313 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  46.5 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  45 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  45 
 
 		 216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  45.23 
 
 		 216 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  45.23 
 
 		 216 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  45.5 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  45.31 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  47.96 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  41.33 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  44 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  44.62 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  44.62 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  43.46 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  40.09 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  43.43 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  42.47 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  41.36 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  41.23 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  37.88 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  37.88 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  40.31 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  38.58 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  38.58 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  38.58 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  38.58 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  38.58 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  38.58 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  38.58 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  38.58 
 
 		 215 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  38.58 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  39.27 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  38.58 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  39.58 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  38.07 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  40.64 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  41.44 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  38.02 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  38.02 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  37.57 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  41.01 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  37.56 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  36.02 
 
 		 191 aa  121  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  36.32 
 
 		 221 aa  115  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  38.04 
 
 		 203 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  38.99 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  34.75 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  29.53 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  29.02 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  31.43 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  29.63 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  29.28 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  28.65 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1682  hypothetical protein  23.75 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.918456  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  28.18 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  27.83 
 
 		 340 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1417  hypothetical protein  25 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.753374  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0199  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase ((ppGpp)ase)  40 
 
 		 667 aa  56.6  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34 
 
 		 705 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  34 
 
 		 705 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.78 
 
 		 717 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0496  RelA/SpoT family protein  27.17 
 
 		 754 aa  54.3  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.140952  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  35.65 
 
 		 722 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32 
 
 		 705 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1281  GTP pyrophosphokinase (ATP:GTP 3'-pyrophosphotransferase)(ppGpp synthetase I) ((P)ppGpp synthetase)  30.47 
 
 		 728 aa  52.8  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl278  guanosine-3', 5'-bis(diphosphate)3'-pyrophosphohydrolase  27.43 
 
 		 765 aa  53.1  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00637437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11397  hypothetical protein  31.1 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1186  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.41 
 
 		 721 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000400543  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2565  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 		 710 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00145552  hitchhiker  0.00000902572 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0343  putative RelA/SpoT family protein  34.21 
 
 		 846 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0377  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  34.21 
 
 		 846 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000730209  normal  0.0150948 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1408  RelA/SpoT family protein  30.82 
 
 		 731 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  33.08 
 
 		 1046 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1288  RelA/SpoT family protein  30.82 
 
 		 723 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0453  RelA/SpoT family protein  30.82 
 
 		 723 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000671385  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0194  GTP pyrophosphokinase  30.07 
 
 		 714 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  22.47 
 
 		 542 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  28.57 
 
 		 381 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_002950  PG1808  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase  28.4 
 
 		 762 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1413  GTP pyrophosphokinase  33.07 
 
 		 734 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1571  GTP pyrophosphokinase  33.07 
 
 		 734 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2071  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  35.19 
 
 		 751 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000208286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2677  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.28 
 
 		 700 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.525072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0731  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.64 
 
 		 769 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.583794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1775  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 735 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.717267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>