More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0884 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  72.2 
 
 		 202 aa  271  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  69.08 
 
 		 198 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  63.24 
 
 		 199 aa  241  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  70.39 
 
 		 202 aa  240  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  59.2 
 
 		 197 aa  237  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  64.22 
 
 		 194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  61.39 
 
 		 195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  59.8 
 
 		 217 aa  230  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  56.57 
 
 		 209 aa  227  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  63.55 
 
 		 196 aa  225  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  57.84 
 
 		 213 aa  224  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  60.62 
 
 		 213 aa  221  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  59.7 
 
 		 205 aa  221  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  62.62 
 
 		 195 aa  218  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  57.21 
 
 		 198 aa  217  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  55.78 
 
 		 201 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  57.64 
 
 		 189 aa  215  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  58.33 
 
 		 202 aa  214  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  60.5 
 
 		 196 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  59.61 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  59.5 
 
 		 196 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  58.91 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  61.39 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  57.07 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  52.2 
 
 		 196 aa  198  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  53.27 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  51 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  50.99 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  50.99 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  50.99 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  55.12 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  56.44 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  47.74 
 
 		 192 aa  171  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  48.74 
 
 		 191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  48.22 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.64 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  40.39 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.5 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  37.62 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.89 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 		 179 aa  145  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  40.7 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  47.18 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  44.5 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  40.8 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  40.2 
 
 		 214 aa  142  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  34.83 
 
 		 189 aa  142  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  39.39 
 
 		 195 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  46.32 
 
 		 191 aa  141  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  43.52 
 
 		 197 aa  141  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  37.2 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  34.33 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  36.19 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0663  peptidyl-tRNA hydrolase  40.91 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118368  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  34.83 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  41 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 186 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  35.32 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  41.41 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 186 aa  138  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  32.99 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  42.5 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  46.02 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  42.5 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.88 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  34.34 
 
 		 184 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  39 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  39 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  43.94 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  44.89 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 		 186 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  36.32 
 
 		 189 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  37.38 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  40.91 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2846  peptidyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 		 194 aa  134  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050583  hitchhiker  0.00000000000287655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  44.74 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  37.69 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  43.43 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  31.66 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.07 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  40.2 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  39.5 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>