More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08270 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.75 
 
 		 224 aa  320  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  68.44 
 
 		 226 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.87 
 
 		 225 aa  241  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.83 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.33 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  52.7 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.5 
 
 		 223 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  56.4 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.45 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.45 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  53.15 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.35 
 
 		 217 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  56.44 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.35 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.98 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  52.25 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  55.83 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.45 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.64 
 
 		 217 aa  204  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.88 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.5 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.22 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.05 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.11 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.29 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.73 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  53.73 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.42 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.17 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.92 
 
 		 221 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.07 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.8 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.11 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.21 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  49.52 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.19 
 
 		 217 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.63 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.52 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.77 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.69 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  55.17 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  51.9 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.61 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.46 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  55.88 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  55.98 
 
 		 214 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  55.88 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.27 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  51.9 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.4 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.66 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.9 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0349  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.98 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0321773  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.39 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.14 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  49.31 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  49.31 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  49.31 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.27 
 
 		 214 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.72 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.27 
 
 		 214 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  51.72 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  51.72 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.63 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  53.88 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  53.55 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  48.85 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  55.88 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  55.88 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  53.88 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  55.88 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  55.88 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  55.88 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  55.88 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  47.49 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3985  DL-methionine transporter permease subunit  54.5 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.5 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  56.65 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.58 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  51.46 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.92 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.46 
 
 		 235 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  56.16 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  49.77 
 
 		 222 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  47.49 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  53.43 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.83 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  49.77 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.77 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.17 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  59.55 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  58.43 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  59.55 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  59.55 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  59.55 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3857  DL-methionine transporter subunit  51.96 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.955348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>