More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3122 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
341 aa  688    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  65.06 
 
 
343 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  64.16 
 
 
343 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  63.86 
 
 
351 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.12 
 
 
339 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  62.08 
 
 
334 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.73 
 
 
341 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  58.46 
 
 
343 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.12 
 
 
341 aa  362  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.93 
 
 
341 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.22 
 
 
338 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.7 
 
 
337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  54.82 
 
 
338 aa  350  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.93 
 
 
337 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  53.87 
 
 
342 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.99 
 
 
342 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.77 
 
 
337 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.2 
 
 
339 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.87 
 
 
337 aa  341  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.2 
 
 
339 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.87 
 
 
341 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.57 
 
 
341 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  51.93 
 
 
337 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.68 
 
 
344 aa  329  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  51.61 
 
 
339 aa  328  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.32 
 
 
308 aa  298  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  50.31 
 
 
328 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.54 
 
 
337 aa  292  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  55.44 
 
 
338 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.68 
 
 
335 aa  287  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.03 
 
 
338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.09 
 
 
355 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.16 
 
 
338 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.13 
 
 
328 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.1 
 
 
353 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.34 
 
 
308 aa  256  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  54.04 
 
 
337 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.55 
 
 
337 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.18 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.55 
 
 
340 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.73 
 
 
364 aa  222  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.7 
 
 
365 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.7 
 
 
365 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  43.33 
 
 
365 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  40.57 
 
 
336 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  40.21 
 
 
336 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  37.28 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.48 
 
 
511 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  38.26 
 
 
336 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  37.62 
 
 
336 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.07 
 
 
348 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  40.07 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  34.31 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  37.41 
 
 
361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.06 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  38.06 
 
 
359 aa  173  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  38.6 
 
 
335 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  39.86 
 
 
332 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  40.43 
 
 
336 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  39.86 
 
 
356 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  41.08 
 
 
365 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  34.94 
 
 
356 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  33.99 
 
 
313 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  37.87 
 
 
352 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  40.07 
 
 
336 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  39.61 
 
 
334 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  39.71 
 
 
336 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  36.6 
 
 
360 aa  169  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  37.62 
 
 
342 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  38.25 
 
 
335 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  37.62 
 
 
342 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  37.62 
 
 
342 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  37.62 
 
 
342 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  37.62 
 
 
342 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  37.62 
 
 
342 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  33.24 
 
 
341 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  37.62 
 
 
342 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  36.84 
 
 
348 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  35.6 
 
 
517 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  37.15 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.99 
 
 
347 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  38.22 
 
 
342 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.84 
 
 
369 aa  165  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.84 
 
 
369 aa  165  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.25 
 
 
511 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  35.95 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  36.05 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  38.22 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  38.22 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  36.24 
 
 
341 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.82 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  40.35 
 
 
327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  37.26 
 
 
342 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  38.38 
 
 
352 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  35.81 
 
 
344 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.65 
 
 
343 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  36.86 
 
 
342 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  36.86 
 
 
342 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  37.25 
 
 
347 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  37.89 
 
 
381 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>