More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3038 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  100 
 
 		 173 aa  350  5.9999999999999994e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  50.98 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  45.34 
 
 		 181 aa  147  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  44.1 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  45.22 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  43.95 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  45.57 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  45.62 
 
 		 183 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  48.23 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  38.35 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3298  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 228 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  36.77 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  33.11 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 158 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  31.97 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  35.46 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 159 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 159 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4312  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0286  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  37.9 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  32.8 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 265 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 265 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  35 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2505  response regulator receiver domain-containing protein  31.88 
 
 		 316 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 126 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.58 
 
 		 584 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  37.61 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1803  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.61 
 
 		 772 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.71 
 
 		 1152 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.06 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  30.89 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  33.33 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  32.52 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  32.23 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  33.06 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  34.17 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  35.83 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 630 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  35.78 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  31.71 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  31.34 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  32.5 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  29.51 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  29.27 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  32.5 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  30.52 
 
 		 737 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  29.51 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  31.01 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1415 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0661  response regulator receiver protein  32 
 
 		 264 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 697 aa  72  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 265 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0417  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 474 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.45134  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>