More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2869 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.28 
 
 		 252 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.21 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 245 aa  178  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  44.94 
 
 		 240 aa  178  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  41.56 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 272 aa  164  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  39.44 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 		 229 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 245 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 		 231 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  37.85 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 244 aa  141  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 238 aa  138  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 234 aa  135  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 234 aa  135  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  35.08 
 
 		 309 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  35.11 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  34.7 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  35.44 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  32.85 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 270 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  36.67 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  33.78 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  33.02 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  31.37 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.4 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  34.45 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 279 aa  99  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 275 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 		 291 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>