291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2816 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  57.5 
 
 
567 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  58.63 
 
 
556 aa  680    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
564 aa  1149    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  51.26 
 
 
560 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  47.83 
 
 
548 aa  511  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  45.7 
 
 
558 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  46.17 
 
 
558 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  45.7 
 
 
558 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  45.86 
 
 
556 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  46.58 
 
 
556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  45.68 
 
 
556 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  46.31 
 
 
557 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  45.8 
 
 
557 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  47.84 
 
 
546 aa  488  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  46.04 
 
 
556 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  46.22 
 
 
556 aa  482  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  45.08 
 
 
557 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  44.42 
 
 
555 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  44.36 
 
 
557 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  44.34 
 
 
556 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  44.36 
 
 
557 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  44.88 
 
 
556 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  44.67 
 
 
555 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  45.32 
 
 
556 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  45.68 
 
 
556 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  46.01 
 
 
548 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  45.78 
 
 
557 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  46.59 
 
 
555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  45.77 
 
 
556 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  44.52 
 
 
556 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  45.86 
 
 
544 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  44.68 
 
 
557 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  46.01 
 
 
550 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.62 
 
 
558 aa  451  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  40.37 
 
 
540 aa  434  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  40.26 
 
 
544 aa  429  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  39.5 
 
 
544 aa  412  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  45.75 
 
 
461 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  37.77 
 
 
542 aa  383  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  45.74 
 
 
447 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  37.79 
 
 
558 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  38.15 
 
 
555 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
558 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 
556 aa  363  6e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  37.9 
 
 
557 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  43.57 
 
 
440 aa  361  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 
557 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  38.79 
 
 
557 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 
559 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 
554 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  36.41 
 
 
558 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  43.6 
 
 
560 aa  333  5e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 
558 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  35.28 
 
 
558 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 
558 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  36.55 
 
 
561 aa  330  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 
549 aa  329  7e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
618 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  36.64 
 
 
533 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  35.53 
 
 
564 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 
560 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  33.81 
 
 
555 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  33.81 
 
 
555 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  34.46 
 
 
554 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  34.75 
 
 
555 aa  318  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 
593 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 
555 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  32.86 
 
 
662 aa  317  4e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  33.99 
 
 
551 aa  316  7e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  33.99 
 
 
551 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  32.86 
 
 
662 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  35.73 
 
 
563 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  32.86 
 
 
662 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 
555 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
551 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  33.69 
 
 
566 aa  313  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 
569 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  36.99 
 
 
572 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  32.33 
 
 
652 aa  312  7.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
554 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.43 
 
 
565 aa  311  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  38.53 
 
 
546 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
554 aa  310  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 
561 aa  310  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 
546 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 
560 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 
561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  35.25 
 
 
675 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 
555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  35.8 
 
 
568 aa  307  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  35.28 
 
 
566 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  37.81 
 
 
550 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  31.73 
 
 
645 aa  306  8.000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 
588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 
588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  38.15 
 
 
561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  35.43 
 
 
551 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.37 
 
 
561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  31.76 
 
 
677 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0306  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.1 
 
 
635 aa  303  6.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>