More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2508 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  100 
 
 		 493 aa  999    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  58.11 
 
 		 497 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  56.81 
 
 		 494 aa  546  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  56.76 
 
 		 495 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  56.88 
 
 		 498 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  57.29 
 
 		 498 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  57.77 
 
 		 493 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  58.02 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  57.74 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  58.53 
 
 		 495 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  58.4 
 
 		 495 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  55.93 
 
 		 495 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  56.9 
 
 		 497 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  55.93 
 
 		 495 aa  528  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  56.25 
 
 		 498 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  55.93 
 
 		 495 aa  528  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  55.37 
 
 		 502 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  54.6 
 
 		 496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  54.37 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  53.25 
 
 		 496 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  53.56 
 
 		 498 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  54.49 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  53.04 
 
 		 501 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  53.44 
 
 		 498 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  52.62 
 
 		 501 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  53.04 
 
 		 501 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  51.16 
 
 		 500 aa  495  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  54.55 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  54.03 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  54.01 
 
 		 496 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  54.01 
 
 		 496 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  54.22 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  52.75 
 
 		 498 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  53.6 
 
 		 499 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  52.3 
 
 		 501 aa  468  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  49.38 
 
 		 504 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  50.31 
 
 		 504 aa  435  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  50.62 
 
 		 507 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  47.82 
 
 		 494 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  49.38 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  47.84 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  42.98 
 
 		 483 aa  391  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  44.92 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  42.8 
 
 		 494 aa  359  7e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 488 aa  358  9.999999999999999e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  43.35 
 
 		 488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  42.62 
 
 		 461 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  44.14 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  41.42 
 
 		 457 aa  336  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  41.42 
 
 		 457 aa  336  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  39.96 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  41.6 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  41.05 
 
 		 442 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  41.39 
 
 		 460 aa  329  8e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  40.5 
 
 		 464 aa  329  8e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  40.16 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  40.29 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  39.26 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  39.26 
 
 		 464 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  41.61 
 
 		 461 aa  323  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  39.05 
 
 		 464 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  38.8 
 
 		 463 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  41.13 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  40.88 
 
 		 472 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  41.46 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  39.88 
 
 		 465 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  40.34 
 
 		 476 aa  319  7.999999999999999e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  38.99 
 
 		 456 aa  319  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  39.67 
 
 		 465 aa  319  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  41.8 
 
 		 479 aa  319  9e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  41 
 
 		 473 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  40.96 
 
 		 472 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  40.29 
 
 		 469 aa  317  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  39.92 
 
 		 456 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  39.46 
 
 		 465 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  39.46 
 
 		 465 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  40.17 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  41.88 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  39.26 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 456 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  40.17 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  38.83 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  40 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  42.47 
 
 		 473 aa  313  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  39.62 
 
 		 468 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  38.95 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  40.17 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  40.21 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  38.27 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  40.5 
 
 		 462 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  41.05 
 
 		 472 aa  310  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  41.05 
 
 		 472 aa  310  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  40.5 
 
 		 462 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  39.87 
 
 		 454 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  39.92 
 
 		 471 aa  309  6.999999999999999e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  39.92 
 
 		 471 aa  309  6.999999999999999e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  40.59 
 
 		 445 aa  309  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  40.79 
 
 		 463 aa  309  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  39.75 
 
 		 454 aa  309  9e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  39.75 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>