231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0444 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0444  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
407 aa  810    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.289818  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 
388 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3210  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.04 
 
 
379 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
380 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2344  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.49 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.84 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1395  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.85 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5141  putative alcohol dehydrogenase  23.08 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237581  normal  0.0395804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0261  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.46 
 
 
385 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883451  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.89 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
358 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4469  alcohol dehydrogenase, iron-containing  24.46 
 
 
385 aa  63.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.29 
 
 
356 aa  62.8  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  26.78 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0260  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.27 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464229 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3761  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.27 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  26.64 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.81 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.62 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.81 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  27.89 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  24.07 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.28 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.81 
 
 
385 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.21 
 
 
362 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  25 
 
 
385 aa  60.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.69 
 
 
355 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  30 
 
 
385 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.41 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.34 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.44 
 
 
355 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.16 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.29 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.19 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  27.12 
 
 
382 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  23.23 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  23.26 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.34 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  23.51 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  24.49 
 
 
357 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.07 
 
 
355 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.12 
 
 
356 aa  57.4  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.22 
 
 
381 aa  57  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.88 
 
 
395 aa  56.6  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1035  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
385 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00140437  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.3 
 
 
383 aa  56.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 
355 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  22.95 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  22.95 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.95 
 
 
383 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0997  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.42 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  22.95 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  22.95 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  22.95 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.15 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  22.95 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.13 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.59 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.43 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  23.74 
 
 
357 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  28.77 
 
 
382 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  31.63 
 
 
352 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.36 
 
 
383 aa  53.9  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1552  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.25 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.41 
 
 
382 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  23.02 
 
 
382 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3438  L-1,2-propanediol oxidoreductase  24.29 
 
 
383 aa  53.5  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  26 
 
 
355 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.89 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.89 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.89 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.89 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.89 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.89 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.27 
 
 
355 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1715  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.54 
 
 
389 aa  53.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131652  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.77 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  21.37 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.44 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.76 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.76 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.48 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.76 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.01 
 
 
355 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  23.67 
 
 
382 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0017  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.75 
 
 
386 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.23 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.76 
 
 
355 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.6 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.6 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>