More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3210 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3210  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 393 aa  779    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4537  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0997  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0444  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.289818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.77 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.49 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.49 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.13 
 
 		 382 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.49 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  28.49 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.49 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  28.49 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.41 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.41 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.95 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.13 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.14 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  29.58 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.32 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3438  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.71 
 
 		 383 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.02 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.06 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.35 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  27.35 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  27.46 
 
 		 357 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  29.67 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.35 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.63 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.07 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  28.33 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5141  putative alcohol dehydrogenase  25.06 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237581  normal  0.0395804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  28.67 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.63 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.79 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  28.33 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  28.33 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  28.33 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  28.33 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.96 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.75 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0599  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.75 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.155589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 		 382 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1839  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.04 
 
 		 383 aa  102  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  25.67 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05234  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06800)  25.45 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.868028  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.95 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  29.63 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  26.68 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  29.63 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  29.38 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.12 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.94 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2733  putative alcohol dehydrogenase  25.68 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0334328  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  27.42 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  27.99 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.79 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.53 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.21 
 
 		 388 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.65 
 
 		 389 aa  99.4  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.29 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.63 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.61 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  27.22 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.97 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1395  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.91 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>