112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1979 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  100 
 
 
164 aa  341  2.9999999999999997e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  84.15 
 
 
164 aa  302  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  82.32 
 
 
164 aa  295  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  80.98 
 
 
164 aa  294  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  78.66 
 
 
164 aa  288  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  79.88 
 
 
165 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  76.83 
 
 
164 aa  285  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  60.98 
 
 
164 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  61.35 
 
 
167 aa  228  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  61.73 
 
 
167 aa  226  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  61.73 
 
 
167 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  58.54 
 
 
164 aa  223  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  55.83 
 
 
171 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  48.5 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  36.36 
 
 
181 aa  94.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 
181 aa  94.7  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  32.9 
 
 
181 aa  90.9  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  34.72 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  34.21 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  34.03 
 
 
177 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  35.42 
 
 
185 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  34.72 
 
 
185 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  34.27 
 
 
184 aa  87.4  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  35.76 
 
 
176 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  35.86 
 
 
168 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  35.86 
 
 
176 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  34.73 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  35.77 
 
 
186 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  36.24 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
191 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  33.1 
 
 
180 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  34.01 
 
 
196 aa  84.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  31.43 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  33.1 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  30.07 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  30.14 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  30.77 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  33.1 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  33.33 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  33.33 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  36.05 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  29.37 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  31.62 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  30.5 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  32.35 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  32.47 
 
 
183 aa  63.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  33.56 
 
 
194 aa  63.9  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  33.56 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  36.05 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  31.62 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  29.22 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  31.76 
 
 
138 aa  57.4  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  28.57 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  33.33 
 
 
195 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  29.05 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  30.32 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  33.04 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  29.22 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0605  Ferritin Dps family protein  29.85 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  27.86 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  31.65 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  26.71 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  28.57 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  29.17 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  28.77 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  27.46 
 
 
161 aa  47.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  32.54 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  27.66 
 
 
142 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  30.94 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  27.27 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  25.53 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  29.58 
 
 
275 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  26.67 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  37.68 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  29.5 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0346  bacterioferritin  27.61 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.934014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  30.77 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  27.61 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  27.7 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  27.14 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  26.67 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  30.22 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  24.54 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  28.37 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  30.22 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  28.19 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  27.41 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  27.61 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  27.61 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  35.82 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  25.85 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  28.26 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1134  Rubrerythrin  24.67 
 
 
309 aa  42.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000119671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  26.67 
 
 
160 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  24.82 
 
 
168 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  28.57 
 
 
158 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>