223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1601 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  391  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  76.47 
 
 
187 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  72.73 
 
 
189 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  72.19 
 
 
187 aa  302  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  70.05 
 
 
187 aa  295  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  68.45 
 
 
187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  66.84 
 
 
187 aa  280  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  42.93 
 
 
183 aa  157  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  38.67 
 
 
186 aa  154  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  39.55 
 
 
186 aa  148  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  37.22 
 
 
187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  37.02 
 
 
184 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  36.96 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  37.16 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  32.6 
 
 
182 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  33.51 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  35.03 
 
 
192 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  31.87 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  34.24 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  35 
 
 
190 aa  106  2e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  34.36 
 
 
193 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  34.59 
 
 
198 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  34.02 
 
 
192 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  31.63 
 
 
191 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  32.97 
 
 
182 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  32.57 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  31.93 
 
 
208 aa  95.5  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  31.02 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  31.76 
 
 
189 aa  94.7  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  32.62 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  31.93 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  32.34 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  32.34 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  28.87 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  31.18 
 
 
196 aa  91.3  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  32.35 
 
 
190 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  32.28 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  32.35 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  32.28 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  31.46 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  31.18 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  30.06 
 
 
174 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88895  predicted protein  37.09 
 
 
288 aa  89.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0380911  hitchhiker  0.00603627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  31.76 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  29.94 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  30.56 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  29.73 
 
 
184 aa  88.6  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  29.78 
 
 
187 aa  87.8  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  30.41 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  30.99 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  32.08 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  31.68 
 
 
188 aa  87  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  33.15 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  31.14 
 
 
184 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  32.34 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  31.85 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  29.14 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  30.22 
 
 
201 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  28.14 
 
 
185 aa  85.1  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  28.34 
 
 
204 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  28.34 
 
 
204 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  28.34 
 
 
204 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  28.74 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  30.54 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  28.99 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  25.75 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  28.99 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  30.77 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  28.99 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  30.56 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  31.65 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  28.99 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  30.28 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  27.59 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  29.12 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  31.33 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  26.34 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  29.35 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  28.4 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  28.99 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  28.32 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  29.21 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  29.21 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  29.21 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  29.35 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  32.02 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  30.95 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  31.76 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  32.1 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  32.1 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  28.57 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  30.3 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  27.98 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  27.42 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  30.86 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  30.77 
 
 
199 aa  80.9  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  30.29 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  28.65 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  30.34 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>