More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7256 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  55.29 
 
 		 207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  54.76 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  52.17 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  55.02 
 
 		 208 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  53.85 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  51.01 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  47.52 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  49.24 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  45.77 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  43.08 
 
 		 198 aa  148  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  44.9 
 
 		 243 aa  144  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  45.18 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  43.9 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  41.71 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  41.58 
 
 		 204 aa  138  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  44.06 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  42.03 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  40.7 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 234 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  38.95 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  41.21 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  42.64 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  41.06 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  41.06 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 		 272 aa  99.8  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  42.44 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  43.29 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40.99 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  36.21 
 
 		 445 aa  95.5  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 		 220 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  41.72 
 
 		 240 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  40.38 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  39.1 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  42.59 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  37.42 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  41.45 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  38.6 
 
 		 205 aa  91.7  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  38.61 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  31.3 
 
 		 281 aa  90.5  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  38.46 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  38.46 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  33.93 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  39.18 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 223 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.64 
 
 		 448 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 214 aa  85.1  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>