More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5863 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
265 aa  544  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  51.89 
 
 
263 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  52.65 
 
 
259 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  51.14 
 
 
265 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  49.24 
 
 
265 aa  247  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  49.03 
 
 
268 aa  239  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  46.95 
 
 
272 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  44.66 
 
 
323 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  45.45 
 
 
326 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  43.24 
 
 
310 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  38.26 
 
 
283 aa  192  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  38 
 
 
279 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 
287 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
261 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
276 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  34.14 
 
 
310 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
327 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  38.49 
 
 
284 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 
273 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  35.18 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 
273 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
280 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
280 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
280 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
279 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 
261 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
279 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
284 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
285 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  29.92 
 
 
258 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  27.87 
 
 
262 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.67 
 
 
286 aa  95.9  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.07 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
282 aa  92  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
270 aa  92  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  28.51 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  28.05 
 
 
233 aa  87  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  30.49 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
270 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
255 aa  79  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 
300 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  39.83 
 
 
425 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  35 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  34.17 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.43 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  33.88 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  31.71 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3529  3-oxoadipate enol-lactonase  28.88 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  41.84 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  36.67 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  29.81 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  35.77 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  25 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  32.46 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.48 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  25.12 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  33.88 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
324 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  31.03 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  31.03 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  31.03 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  26.98 
 
 
380 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
295 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>