291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5846 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 245 aa  477  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5056  putative transcriptional regulator, MerR family  44.89 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0439  MerR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1948  transcriptional regulator, MerR family  41.31 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566007  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1167  transcriptional regulator, MerR family  43.89 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2421  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2297  regulatory protein, MerR  41.18 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6176  transcriptional regulator, MerR family  40.93 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1011  transcriptional regulator, MerR family  43.5 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  47.11 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1563  transcriptional regulator, MerR family  43.54 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  0.968218 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5382  transcriptional regulator, MerR family  44.65 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  38.76 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3253  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000117096  decreased coverage  0.00000535061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1516  transcriptional regulator, MerR family  25.11 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  38.26 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  36.14 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3149  transcriptional regulator, MerR family  28.65 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  36.14 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 139 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  35.82 
 
 		 148 aa  52.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 137 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  48.98 
 
 		 159 aa  52.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 155 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 648 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  49.15 
 
 		 327 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  42.25 
 
 		 138 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3050  transcriptional regulator, MerR family protein  24.18 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01300  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 104 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 134 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  21.1 
 
 		 128 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 134 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0194  transcriptional regulator, MerR family  28.06 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  41.33 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 134 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  30.93 
 
 		 139 aa  49.3  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  26.98 
 
 		 134 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 134 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  26.98 
 
 		 134 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  44 
 
 		 158 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 134 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  26.15 
 
 		 154 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  31.31 
 
 		 132 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  26.98 
 
 		 144 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  29.47 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  35.53 
 
 		 274 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  29.81 
 
 		 129 aa  48.5  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  37.89 
 
 		 124 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  33.6 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 156 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  45.76 
 
 		 177 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 135 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 127 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 128 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 128 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 133 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 136 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  38.89 
 
 		 142 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 138 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  40.82 
 
 		 153 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 152 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 143 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 136 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  34.85 
 
 		 171 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  31.53 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  34.85 
 
 		 171 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 136 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  39.13 
 
 		 361 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  34.85 
 
 		 176 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  34.85 
 
 		 176 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  23.23 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  47.62 
 
 		 171 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 128 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>