More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4374 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4374  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
347 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  61.28 
 
 
347 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  61.29 
 
 
334 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  64.14 
 
 
321 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2655  cation diffusion facilitator family transporter  66.55 
 
 
333 aa  318  9e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6562  cation efflux family protein  59.93 
 
 
317 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  48.99 
 
 
314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  47.29 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 
299 aa  189  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  36.77 
 
 
299 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  34.91 
 
 
299 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  33.96 
 
 
299 aa  185  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  35.97 
 
 
398 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  37.67 
 
 
306 aa  179  9e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  35.4 
 
 
299 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  35.4 
 
 
299 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  41.04 
 
 
339 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.05 
 
 
299 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.71 
 
 
299 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 
342 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  38.26 
 
 
378 aa  176  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
332 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  38.97 
 
 
325 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  36.64 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  39.01 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  34.81 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  41.5 
 
 
342 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.05 
 
 
299 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  34.5 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
316 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  35.99 
 
 
359 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
342 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 
342 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.67 
 
 
314 aa  169  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  37.62 
 
 
303 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  38.7 
 
 
308 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  36.92 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  33.96 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  35.88 
 
 
311 aa  166  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  37.86 
 
 
340 aa  166  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  36.99 
 
 
305 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  35.88 
 
 
626 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  37.79 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  37.12 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  37.12 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  35.1 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  35.1 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  37.12 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  34.62 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  30.52 
 
 
313 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  36.26 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  36.26 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 
305 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 
305 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  40.46 
 
 
306 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 
298 aa  161  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  37 
 
 
308 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 
294 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  32.84 
 
 
311 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 
312 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  39.44 
 
 
306 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 
325 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 
325 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  35.09 
 
 
315 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  38.56 
 
 
328 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 
318 aa  159  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 
607 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 
308 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  29.56 
 
 
306 aa  158  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 
325 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  31.25 
 
 
301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 
301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 
301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 
301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 
305 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  39.12 
 
 
342 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  36.84 
 
 
305 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
313 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  32.73 
 
 
312 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 
320 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  32.76 
 
 
312 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  37.22 
 
 
307 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  37.93 
 
 
305 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  32.65 
 
 
299 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  32.76 
 
 
312 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  34.06 
 
 
333 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
329 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 
304 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 
300 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  38.21 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 
339 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  32.03 
 
 
312 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>