68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2120 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2120  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  283  5e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2408  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  283  5e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0948  CBS domain containing membrane protein  57.58 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3340  CBS domain containing protein  54.55 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3057  CBS domain-containing protein  47.06 
 
 		 142 aa  135  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.193556  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  23.93 
 
 		 382 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  25.18 
 
 		 378 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  22.22 
 
 		 382 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0789  putative transcriptional regulator, XRE family  26.72 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1822  CBS domain containing protein  22.79 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  25.55 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  26.95 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  24.44 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1825  CBS domain-containing protein  24.17 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1687  putative transcriptional regulator, XRE family  22.22 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  27.5 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  26.79 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1597  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0544  CBS domain-containing protein  26.02 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.761557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0943  putative signal transduction protein with CBS domains  23.4 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  26.36 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  26.36 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  26.36 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 279 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  26.15 
 
 		 348 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  26.72 
 
 		 339 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  27.08 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  18.49 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.18 
 
 		 494 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  27.82 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1400  CBS domain-containing protein  23.97 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 		 404 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.56 
 
 		 486 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  25.98 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  25.5 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  23.28 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.41 
 
 		 489 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  26.92 
 
 		 423 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0363  KpsF/GutQ family protein  28.3 
 
 		 344 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103679  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 		 144 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  26.19 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  21.88 
 
 		 385 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  25.71 
 
 		 280 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  26.09 
 
 		 256 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28539  predicted protein  25.83 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0000000139364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  21.88 
 
 		 385 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  27.01 
 
 		 149 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  26.45 
 
 		 309 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0305  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.27 
 
 		 476 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  22.31 
 
 		 500 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  21.64 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  36.96 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  26.79 
 
 		 348 aa  40.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  27.68 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  23.89 
 
 		 232 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  24.35 
 
 		 391 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  28.32 
 
 		 319 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  29.41 
 
 		 456 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  26.36 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2414  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.57 
 
 		 436 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000798008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  23.08 
 
 		 227 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.21 
 
 		 488 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  42.11 
 
 		 307 aa  40  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>