228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0717 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  98.62 
 
 		 436 aa  837    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  100 
 
 		 443 aa  861    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0152  amino acid permease family protein  45.92 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237797  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21570  amino acid transporter  32.96 
 
 		 503 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.393168  hitchhiker  0.00168939 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0221  amino acid permease-associated region  36.05 
 
 		 490 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  31.04 
 
 		 502 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  34.52 
 
 		 496 aa  242  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0621  amino acid permease-associated region  33.41 
 
 		 494 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0607  amino acid permease-associated region  33.41 
 
 		 494 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  28.48 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 468 aa  156  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  27.9 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1276  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22930  amino acid transporter  22.08 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0974202 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  23.83 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  24.23 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  20 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  22.25 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  23.6 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  22.22 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  23.09 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  21.23 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  23.09 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  23.09 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  24.14 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  24.44 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  22.25 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  21.37 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  22.25 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  26.19 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  21.55 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  21.37 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  21.37 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  21.08 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  22.38 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  20.72 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  22.75 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1651  amino acid permease-associated region  23.25 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  22.49 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  21.56 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  23.72 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  22.15 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  22.75 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0408  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 410 aa  57  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23.23 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23.23 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23.23 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0941  amino acid permease family protein  22.48 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000289126 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  20.99 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  21.16 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  21.79 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0937  amino acid permease family protein  22.48 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  22.44 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0754  arginine/ornithine antiporter  22.48 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4436  amino acid permease family protein  22.48 
 
 		 474 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0280359  normal  0.0537632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  21.57 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  20.05 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  21.57 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  24.11 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  24.05 
 
 		 559 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  21.57 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  23.41 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  21.78 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  22.3 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  23.51 
 
 		 464 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 463 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00777  putative cationic amino acid transport protein  26.41 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  23.59 
 
 		 449 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  23.78 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1029  amino acid permease family protein  22.48 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.530326  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  22.91 
 
 		 465 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  22.04 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0755  amino acid permease-associated region  21.7 
 
 		 474 aa  53.5  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.254398  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  22.96 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  22.89 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0749  arginine/ornithine antiporter  23.22 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000982146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  21.81 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  21.58 
 
 		 471 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  24.21 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1685  amino acid permease-associated region  21.81 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0901  amino acid permease family protein  21.87 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.264525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  21.58 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 		 545 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>