48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0509 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0509  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  289  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0521  MarR family transcriptional regulator  94 
 
 		 150 aa  274  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3318  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213533  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  17.99 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  19.42 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  17.61 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  21.64 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 188 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0154  adc operon repressor AdcR  29.82 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  20.69 
 
 		 161 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  16.67 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  19.72 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  19.05 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  17.78 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  18.8 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  24.65 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  24.17 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  19.55 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  19.26 
 
 		 151 aa  40  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 165 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>