More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0319 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  100 
 
 		 455 aa  905    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  94.57 
 
 		 738 aa  840    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  61.42 
 
 		 727 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  58.03 
 
 		 734 aa  521  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  57.8 
 
 		 734 aa  519  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  52.69 
 
 		 739 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  54.36 
 
 		 727 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  58.49 
 
 		 521 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  45.03 
 
 		 717 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  46.14 
 
 		 747 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  41.84 
 
 		 721 aa  355  8.999999999999999e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  45.18 
 
 		 716 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  42.82 
 
 		 760 aa  352  8e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  44.61 
 
 		 759 aa  350  3e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  41.49 
 
 		 738 aa  341  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  42.01 
 
 		 716 aa  328  9e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  40.75 
 
 		 721 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  39.36 
 
 		 722 aa  319  5e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.61 
 
 		 1000 aa  316  6e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  40.87 
 
 		 715 aa  315  8e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  38.1 
 
 		 1038 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  38.1 
 
 		 1038 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.32 
 
 		 1019 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  36.24 
 
 		 1003 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.55 
 
 		 908 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  38.75 
 
 		 906 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  39.06 
 
 		 906 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.01 
 
 		 1008 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.01 
 
 		 1008 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.13 
 
 		 1018 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  37.44 
 
 		 1024 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  35.23 
 
 		 1042 aa  303  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  38.33 
 
 		 1040 aa  298  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  36.96 
 
 		 908 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  35.55 
 
 		 865 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  40.48 
 
 		 1018 aa  296  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.24 
 
 		 1018 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  37.47 
 
 		 870 aa  293  6e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  36.55 
 
 		 930 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  37.78 
 
 		 575 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.89 
 
 		 1016 aa  291  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  40.32 
 
 		 556 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  35.32 
 
 		 892 aa  289  7e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  34.1 
 
 		 714 aa  289  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.22 
 
 		 1013 aa  288  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 576 aa  286  4e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 575 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.31 
 
 		 1006 aa  286  5.999999999999999e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  38.06 
 
 		 699 aa  286  7e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  36.24 
 
 		 739 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  34.4 
 
 		 999 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  35.9 
 
 		 1012 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  35.33 
 
 		 720 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  36.34 
 
 		 971 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  35.32 
 
 		 1001 aa  283  6.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  38.8 
 
 		 980 aa  282  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  38.88 
 
 		 777 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  34.82 
 
 		 741 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  39.22 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  36.34 
 
 		 975 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  34.43 
 
 		 726 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  35.12 
 
 		 719 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  36.55 
 
 		 650 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  36.34 
 
 		 976 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  35.37 
 
 		 1013 aa  276  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  35.63 
 
 		 578 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  38.27 
 
 		 588 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  34.77 
 
 		 591 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  37.44 
 
 		 706 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  35.53 
 
 		 726 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  35.09 
 
 		 700 aa  274  3e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.72 
 
 		 586 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2828  ABC transporter, ATPase subunit  35.55 
 
 		 618 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  36.73 
 
 		 594 aa  273  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  34.4 
 
 		 712 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.15 
 
 		 597 aa  272  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  33.94 
 
 		 712 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  34.23 
 
 		 743 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  36.56 
 
 		 610 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.07 
 
 		 578 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  30.37 
 
 		 663 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.07 
 
 		 578 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.56 
 
 		 609 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.25 
 
 		 571 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  33.86 
 
 		 591 aa  270  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  33.79 
 
 		 600 aa  269  7e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.32 
 
 		 597 aa  269  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  36.02 
 
 		 611 aa  269  8e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.66 
 
 		 627 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  36.28 
 
 		 608 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.48 
 
 		 586 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  36.26 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  33.94 
 
 		 712 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.67 
 
 		 768 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  35.79 
 
 		 770 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0973  multidrug ABC transporter  37.7 
 
 		 568 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.92 
 
 		 586 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36.47 
 
 		 584 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  35.79 
 
 		 750 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  35.75 
 
 		 613 aa  267  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>