More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0227 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  94.49 
 
 		 399 aa  709    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  100 
 
 		 399 aa  777    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  43.43 
 
 		 396 aa  299  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.25 
 
 		 418 aa  283  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  36.78 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  37.37 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  37.37 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  37.12 
 
 		 387 aa  259  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  37.12 
 
 		 387 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  37.12 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  37.37 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  37.12 
 
 		 387 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  37.12 
 
 		 387 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  36.83 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  38.12 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  38.12 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  38.12 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  38.12 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  36.11 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  37.86 
 
 		 375 aa  252  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  37.86 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  38.18 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  41.09 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  37.6 
 
 		 375 aa  249  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  39.43 
 
 		 445 aa  246  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  38.12 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  37.86 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  37.86 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  37.37 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  36.25 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  38.68 
 
 		 412 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  36.17 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  35.51 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 		 389 aa  206  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  33.67 
 
 		 379 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 		 473 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  33.83 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.86 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 		 491 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 399 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  34.25 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  32.95 
 
 		 474 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  36.12 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  34.17 
 
 		 385 aa  176  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  34.88 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  34.26 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 		 404 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 		 413 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  32.46 
 
 		 467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  32.46 
 
 		 467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  32.66 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  35.41 
 
 		 485 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.41 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0547  Kef-type K+ transport systems, membrane component  30.55 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  29.41 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  34.83 
 
 		 479 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  34.83 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  32.05 
 
 		 513 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  29.23 
 
 		 414 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  28.5 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 		 741 aa  143  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  32.51 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  31.28 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  26.7 
 
 		 806 aa  140  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  30.87 
 
 		 585 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 		 587 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.14 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  30.36 
 
 		 585 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 		 586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  31.69 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  26.13 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 586 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  26.08 
 
 		 387 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 		 457 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 		 586 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 		 457 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.2 
 
 		 587 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 		 586 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 		 586 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>