220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1205 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  53.2 
 
 
206 aa  227  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  48.77 
 
 
207 aa  214  5e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 
205 aa  191  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  46.15 
 
 
205 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  45.41 
 
 
205 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  45.64 
 
 
205 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  46.15 
 
 
205 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  46.15 
 
 
205 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  45.64 
 
 
205 aa  184  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  46.15 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  45.64 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0773  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195628  hitchhiker  0.00363366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  45.13 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
205 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
205 aa  171  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  41.97 
 
 
194 aa  167  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1029  mutT/nudix family protein, truncation  100 
 
 
83 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.320813  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 
209 aa  162  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  40.3 
 
 
206 aa  159  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
205 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
209 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  36.95 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  35.2 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  34 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
210 aa  124  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  31.84 
 
 
220 aa  122  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  31.6 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1838  NUDIX hydrolase  26.64 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
153 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  30.4 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  30.4 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  28.33 
 
 
168 aa  56.6  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
155 aa  54.7  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  27.12 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  30.08 
 
 
136 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  26.43 
 
 
141 aa  52  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  30.08 
 
 
136 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
174 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  30.08 
 
 
136 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
166 aa  51.6  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 
181 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  20.47 
 
 
157 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
162 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  26.72 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  25 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  23.74 
 
 
160 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  24.37 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  23.19 
 
 
146 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 
282 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
181 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  26.12 
 
 
195 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  25.64 
 
 
149 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  23.93 
 
 
183 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  25.64 
 
 
149 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.58 
 
 
160 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  27.59 
 
 
177 aa  48.9  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  25.64 
 
 
140 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  26.72 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  23.93 
 
 
185 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 
195 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  24.64 
 
 
141 aa  48.1  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  25.64 
 
 
149 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  21.21 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  25 
 
 
144 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  24.14 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  24.79 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  24.82 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 
236 aa  47  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  25.64 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  25.86 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  25.86 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  25.86 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  25.86 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  25.86 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  25.86 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 
182 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  26.05 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  25.86 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  23.77 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  30.48 
 
 
156 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  25.86 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  24.51 
 
 
181 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>