234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF02380 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF02380  conserved hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  653    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.76 
 
 
569 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.75 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0479  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.37 
 
 
312 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0186  gluconolactonase  31.96 
 
 
311 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0122  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.33 
 
 
308 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271646  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00470  conserved hypothetical protein  29.82 
 
 
315 aa  102  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  34.72 
 
 
546 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.58 
 
 
292 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.81 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  32.86 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.08 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.38 
 
 
318 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  33.17 
 
 
295 aa  95.9  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0220  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.03 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0524  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.55 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.08 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.58 
 
 
302 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.41 
 
 
281 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.05 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  31.05 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  26.76 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  27.61 
 
 
300 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  28.04 
 
 
300 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  34.85 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.22 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.37 
 
 
289 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  33.17 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5175  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.66 
 
 
296 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0979633  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  26.03 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  34.16 
 
 
291 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0183  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.43 
 
 
316 aa  90.1  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0284148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  26.53 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0840  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.83 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  26.87 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.6 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0165  gluconolactonase  29.63 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  30.1 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.6 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.07 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  35.23 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  30.1 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2337  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.44 
 
 
289 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992536  normal  0.0209348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.35 
 
 
304 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  27.8 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02040  gluconolactonase  35.47 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  32.37 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  27.87 
 
 
303 aa  86.7  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5444  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.57 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.81 
 
 
289 aa  85.9  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.54 
 
 
304 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0604  gluconolactonase  33.63 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0638316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0358  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.05 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.0997512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.23 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  28.39 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  27.57 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3342  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.49 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3180  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  34.02 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29900  gluconolactonase  30.66 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.95 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2571  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233694  normal  0.0110739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  26.15 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.35 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.15283  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2670  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.47 
 
 
574 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142476  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.94 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  27.93 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4224  gluconolactonase  34.1 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.01 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.42 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  32.95 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2536  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.51 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0568  regucalcin family protein  32.65 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2840  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.21 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.05 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  30.97 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0015  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.51 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.15 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.31 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.16 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.31 
 
 
574 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0419  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.57 
 
 
296 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.22 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.72815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.53 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01688  calcium homeostasis protein Regucalcin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08610)  29.5 
 
 
442 aa  76.3  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.861839  normal  0.297769 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.33 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.58 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724481  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3831  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.77 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  31.36 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4143  gluconolactonase  32.97 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670498  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.17 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.17 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.4 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.95 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0016  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.99 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.726882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4759  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.19 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  30.96 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3491  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  31.95 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.31 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.51 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>