More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03250 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA03250  hst3 protein, putative  100 
 
 		 389 aa  800    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49645  NAD-dependent deacetylase HST3 (Homologous to SIR2 protein 3)  38.94 
 
 		 342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838214  normal  0.585457 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01226  SIR2 family histone deacetylase (Hst4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10540)  33.66 
 
 		 595 aa  179  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.184046 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04500  hst4 protein, putative  35.31 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.268314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40594  NAD-dependent histone deacetylase SIR2 (Regulatory protein SIR2) (Silent information regulator 2)  32.18 
 
 		 391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.326026 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_2658  NAD-dependent histone deacetylase  33.73 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.755641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  31.58 
 
 		 248 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  29.97 
 
 		 251 aa  96.3  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  29.53 
 
 		 234 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07461  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05900)  31.97 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.12277 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10449  histone deacetylase (Eurofung)  28.67 
 
 		 489 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.882233 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  31.67 
 
 		 241 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32025  putative histone deacetylase-like protein  26.65 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.822239  normal  0.176883 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  31.39 
 
 		 245 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  26.46 
 
 		 256 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  31.09 
 
 		 250 aa  90.9  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  33.61 
 
 		 243 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02940  histone deacetylase, putative  34 
 
 		 596 aa  90.1  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8827  predicted protein  31.62 
 
 		 219 aa  90.1  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  29.82 
 
 		 244 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  29.82 
 
 		 244 aa  90.1  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16859  predicted protein  35.15 
 
 		 264 aa  90.1  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  32.79 
 
 		 254 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  30.58 
 
 		 242 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  30.17 
 
 		 245 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  30.17 
 
 		 245 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  30.71 
 
 		 246 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08450  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00520)  28.36 
 
 		 2081 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.601211 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  29.13 
 
 		 246 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 251 aa  86.3  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  29.88 
 
 		 242 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  29.68 
 
 		 263 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  28.72 
 
 		 246 aa  85.9  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  30.5 
 
 		 245 aa  85.9  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  28.87 
 
 		 251 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  29.34 
 
 		 242 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  28.04 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  30.99 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  28.04 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  29.05 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  29.75 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  29.75 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  28.02 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  29.45 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  30.45 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  30.58 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  28.97 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  27.67 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  28.33 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  26.51 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  27.54 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  28.03 
 
 		 251 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  27.5 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  29.89 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  31.69 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  24.92 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16771  predicted protein  30.67 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0241463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  28.69 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  30.71 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  25.17 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  26.15 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  28.68 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  25.59 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  29.37 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  26.35 
 
 		 250 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  28.71 
 
 		 256 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  29.67 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  29.69 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  26.32 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04320  NAD-dependent histone deacetylase, putative  29.22 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00681381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  30.08 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  28.86 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  31.94 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  28.27 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  30.04 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  29.34 
 
 		 252 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  26.35 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  26.86 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  25.83 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  29.02 
 
 		 248 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  28.63 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  28.21 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  27.21 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  28.44 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  30.74 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  28.25 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  26.33 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  26.67 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  28.14 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  26.98 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0208  NAD-dependent deacetylase  29.61 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  30.74 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  26.98 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  28.02 
 
 		 267 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  28.11 
 
 		 249 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0091  NAD-dependent deacetylase  24.4 
 
 		 237 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0206655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  28.14 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52135  silent information regulator protein Sir2  28.26 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  25.82 
 
 		 244 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>