63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1529 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  79.19 
 
 
605 aa  935    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  100 
 
 
605 aa  1234    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  79.77 
 
 
607 aa  944    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  87.11 
 
 
605 aa  1087    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  53.16 
 
 
608 aa  618  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  37.2 
 
 
570 aa  278  2e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  38.04 
 
 
604 aa  264  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  36.96 
 
 
617 aa  260  4e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  37.4 
 
 
626 aa  258  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  32.66 
 
 
653 aa  252  2e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  32.96 
 
 
629 aa  252  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  36.21 
 
 
632 aa  247  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  33.4 
 
 
647 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  32.64 
 
 
638 aa  237  4e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  31.95 
 
 
635 aa  233  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  36.32 
 
 
638 aa  229  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  34.91 
 
 
578 aa  226  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  32.63 
 
 
649 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  33.02 
 
 
625 aa  218  4e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  32.7 
 
 
654 aa  216  7e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  30.77 
 
 
666 aa  200  7e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  29.72 
 
 
661 aa  199  9e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  29.5 
 
 
627 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  26.57 
 
 
616 aa  99  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  28.62 
 
 
618 aa  96.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  25.99 
 
 
671 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  25.54 
 
 
648 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  28.74 
 
 
470 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  27.35 
 
 
629 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  25.28 
 
 
891 aa  78.6  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  23.1 
 
 
841 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  26.02 
 
 
662 aa  67.4  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  26.72 
 
 
623 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
839 aa  64.7  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  26.55 
 
 
430 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
826 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
826 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  23.78 
 
 
826 aa  60.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  27.98 
 
 
578 aa  60.8  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  26.92 
 
 
833 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  21.19 
 
 
626 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  26.63 
 
 
507 aa  58.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  27.16 
 
 
833 aa  58.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  24.5 
 
 
1179 aa  57.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  22.03 
 
 
821 aa  57.4  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  24.43 
 
 
509 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  26.82 
 
 
837 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  26.45 
 
 
823 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  21.72 
 
 
700 aa  54.3  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  23.53 
 
 
446 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  26.23 
 
 
841 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  24.59 
 
 
812 aa  51.6  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  23.89 
 
 
820 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  21.71 
 
 
824 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  22.28 
 
 
871 aa  48.9  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  22.89 
 
 
822 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  22.22 
 
 
430 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  28.77 
 
 
244 aa  47  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2831  hypothetical protein  26.38 
 
 
271 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 
822 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  28.22 
 
 
676 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  19.5 
 
 
825 aa  44.3  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  21.66 
 
 
702 aa  43.5  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>