17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2831 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2831  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4766  hypothetical protein  36.8 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1898  hypothetical protein  34.16 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.521574  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1896  hypothetical protein  34.55 
 
 		 363 aa  125  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0040  hypothetical protein  30.15 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3737  hypothetical protein  27.2 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4943  hypothetical protein  25.94 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.465908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0417  hypothetical protein  24.9 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2767  lipopolysaccharide core biosynthesis domain protein  22.99 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0159564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2806  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  23.16 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3016  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  22.6 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  0.0985209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  29.09 
 
 		 873 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  26.38 
 
 		 605 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2663  hypothetical protein  22.03 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2496  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  23.53 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  24.5 
 
 		 605 aa  42.7  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  25.47 
 
 		 820 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>