More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2884 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2884  a-glycosyltransferase  100 
 
 
370 aa  765    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0290347  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5603  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
403 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0985  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
450 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
417 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
384 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  24.54 
 
 
415 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
388 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  27.91 
 
 
359 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
384 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  21.69 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  26.44 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.84 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  24.72 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.18 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  22.01 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.45 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.45 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  38.68 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.63 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.75 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.95 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
810 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
819 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  21.58 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.11 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  24.85 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
372 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  21.12 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.16 
 
 
365 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
382 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  29.22 
 
 
803 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  23.79 
 
 
452 aa  66.2  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
803 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.39 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  22.04 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.89 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  25.39 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
388 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  25 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
371 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  31.06 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.17 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.06 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>