More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1975 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1975  thioredoxin-like protein  100 
 
 		 170 aa  352  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  41.5 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06420  Thiol:disulfide interchange protein tlpA  39.46 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601051  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.64 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1906  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.69 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.74 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.2 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  29.22 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  33.06 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  27.72 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  35.77 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  26.43 
 
 		 268 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  29.06 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  32.48 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.35 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.77 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.33 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  27.92 
 
 		 306 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  32.17 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  38.24 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  27.92 
 
 		 306 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  32.38 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.93 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  28.91 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  31.58 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  24.34 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  26.72 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  25.76 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  22.89 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  30.14 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02625  hypothetical protein  41.82 
 
 		 466 aa  55.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  33.82 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  33.67 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  27.14 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  23.61 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  28.44 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.09 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  25.35 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  24.65 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  29.27 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  33.33 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  25.35 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  29.06 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1400  Redoxin domain protein  30.08 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  25.35 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  26.67 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  27.45 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2372  hypothetical protein  41.38 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000519623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  29.2 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  29.63 
 
 		 316 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.31 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  30.97 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.78 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  35 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  29.31 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  25.6 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  33.33 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  34.78 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  24.26 
 
 		 267 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  31.53 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  29.2 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.4 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  27.97 
 
 		 316 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  28.04 
 
 		 332 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  28.04 
 
 		 305 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.06 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  27.86 
 
 		 332 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.58 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  36.67 
 
 		 301 aa  52.4  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  36.73 
 
 		 211 aa  52.4  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  27.64 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  31.03 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  25.95 
 
 		 278 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4550  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.31 
 
 		 487 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00323854  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3292  Redoxin domain protein  29.89 
 
 		 453 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000783621  hitchhiker  0.000211392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.33 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.67 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1023  putative signal peptide protein  28.12 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  28.57 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4092  signal peptide protein  27.68 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  27.87 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  31.03 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.95 
 
 		 455 aa  51.6  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  27.13 
 
 		 278 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  25.35 
 
 		 155 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  27.13 
 
 		 278 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  32.86 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  30.43 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  42.62 
 
 		 110 aa  51.2  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  38.27 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  28.95 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.26 
 
 		 195 aa  50.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  31.71 
 
 		 194 aa  50.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1788  Redoxin domain protein  26.62 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0994  hypothetical protein  26.92 
 
 		 311 aa  50.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>