37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1461 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 786 aa  1602    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2928  hypothetical protein  41.53 
 
 		 678 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000841145  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1265 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.96 
 
 		 306 aa  72  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.82 
 
 		 11716 aa  68.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  29.1 
 
 		 686 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.1 
 
 		 6678 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  28.73 
 
 		 1310 aa  64.7  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  29.69 
 
 		 3699 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.19 
 
 		 4761 aa  64.3  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  30.13 
 
 		 2503 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.09 
 
 		 3699 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  30.46 
 
 		 1708 aa  61.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0515  hypothetical protein  26.54 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  28.93 
 
 		 1159 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.14 
 
 		 585 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  31.58 
 
 		 1597 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  25.96 
 
 		 793 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.93 
 
 		 598 aa  52  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  34.44 
 
 		 1620 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.3 
 
 		 3507 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  30.39 
 
 		 1735 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  27.78 
 
 		 424 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  26.75 
 
 		 1306 aa  48.9  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  31.07 
 
 		 4433 aa  48.5  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.7 
 
 		 1298 aa  48.5  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  37.84 
 
 		 924 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  31.79 
 
 		 1602 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25 
 
 		 655 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  28.3 
 
 		 406 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  28.4 
 
 		 739 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.82 
 
 		 1657 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.59 
 
 		 603 aa  45.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  31.71 
 
 		 2066 aa  45.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  23.96 
 
 		 2374 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  21.71 
 
 		 1967 aa  44.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  28.07 
 
 		 2447 aa  43.9  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>