66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0586 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0586  membrane protein  100 
 
 		 459 aa  938    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  24.01 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  28.44 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  21.88 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.45 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  22.43 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.01 
 
 		 376 aa  67  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.22 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  23.77 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.79 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.25 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  23.24 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  23.66 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.14 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  22.34 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.61 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  21.56 
 
 		 527 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0817  PepSY-associated TM helix domain protein  22.14 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  23.97 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  24.94 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.31 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  22.73 
 
 		 370 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  23.16 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  21.27 
 
 		 348 aa  53.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.89 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.25 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  23.33 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  23.24 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  24.23 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.96 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  23.92 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.6 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  21.45 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.35 
 
 		 530 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  22.13 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  21.43 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.22 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  26.8 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.14 
 
 		 382 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  18.62 
 
 		 381 aa  47  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  20.5 
 
 		 377 aa  47  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  23.71 
 
 		 397 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.42 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  26.55 
 
 		 411 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  21.11 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  19.37 
 
 		 627 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  20.55 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2723  putative iron-regulated membrane protein  32.39 
 
 		 372 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.6 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  20.4 
 
 		 351 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  25.56 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.51 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  22.07 
 
 		 366 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  23.28 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2949  hypothetical protein  20.18 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.22 
 
 		 554 aa  44.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  34.33 
 
 		 504 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.98 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  35.21 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  35.82 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  44.9 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  20.95 
 
 		 497 aa  43.9  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  21.69 
 
 		 366 aa  43.9  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  18.78 
 
 		 496 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  19.16 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  19.16 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>