More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1665 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1665  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 157 aa  312  9.999999999999999e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.701017  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1318  50S ribosomal protein L10  75.16 
 
 		 161 aa  232  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000548659  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0447  50S ribosomal protein L10  69.62 
 
 		 159 aa  227  5e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000981328  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0172  50S ribosomal protein L10  73.25 
 
 		 161 aa  226  7e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.33126  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  71.97 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1458  50S ribosomal protein L10  67.72 
 
 		 159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000221032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0507  50S ribosomal protein L10  67.09 
 
 		 159 aa  218  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000655679  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0526  50S ribosomal protein L10  67.09 
 
 		 159 aa  217  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.142497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0351  ribosomal protein L10  57.05 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0874946  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0351  50S ribosomal protein L10  55.13 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00255818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  39.6 
 
 		 174 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  31.68 
 
 		 170 aa  94  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  36.91 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  34.46 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  34.46 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  35.95 
 
 		 172 aa  91.3  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  32.89 
 
 		 174 aa  90.9  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  34.59 
 
 		 166 aa  90.9  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 181 aa  90.9  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  32.24 
 
 		 166 aa  90.1  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  30.82 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  30.82 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 172 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  34.16 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 174 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  34.9 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  34.9 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  32.28 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 174 aa  87.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  29.73 
 
 		 172 aa  87.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 174 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  31.21 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  31.91 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  35 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  35 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  35 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  35 
 
 		 184 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  35 
 
 		 184 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  32.9 
 
 		 256 aa  84.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  35 
 
 		 184 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 172 aa  84.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  35 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  35 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  35.04 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  30.97 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  31.25 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  35.95 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  31.98 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  30.13 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  30.13 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  31.76 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  37.78 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  31.13 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  33.97 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  34.06 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  31.46 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  34.06 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  31.58 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  33.56 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  31.68 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  33.97 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  29.68 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  29.22 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  31.33 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  31.33 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  32.47 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  29.41 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  36.3 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  33.56 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  34.27 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  30.5 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  32.87 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  29.89 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  29.05 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>