More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1559 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  100 
 
 
186 aa  367  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  44.32 
 
 
191 aa  134  8e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  48.48 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  48.91 
 
 
152 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  65.06 
 
 
153 aa  108  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  42.21 
 
 
170 aa  102  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  39.38 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  47.87 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  44.14 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  53.52 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  53.52 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  66.07 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  66.07 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  37.27 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  64.71 
 
 
133 aa  72  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0359  hypothetical protein  33.82 
 
 
541 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0177476  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  56.86 
 
 
143 aa  63.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  59.18 
 
 
136 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  44.07 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  48.08 
 
 
67 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  51.85 
 
 
137 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  52.94 
 
 
141 aa  58.5  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1480  transformation system protein  51.56 
 
 
82 aa  57  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.754405  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  45.07 
 
 
232 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  47.37 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  33.02 
 
 
191 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  63.16 
 
 
195 aa  54.3  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.76 
 
 
151 aa  54.7  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25.83 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  45.28 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  38.24 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  39.66 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  38.24 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  42.86 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  42.86 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  38.24 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.96 
 
 
158 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.4 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  39.34 
 
 
150 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
163 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  52  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  50.88 
 
 
202 aa  52  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  36.07 
 
 
149 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  36.07 
 
 
149 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.52 
 
 
175 aa  52  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.64 
 
 
157 aa  51.6  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  55 
 
 
165 aa  52  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  34.43 
 
 
144 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  37.33 
 
 
129 aa  51.6  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.92 
 
 
167 aa  51.6  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 
144 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
153 aa  51.2  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  41.79 
 
 
158 aa  51.6  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 
147 aa  51.6  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
154 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  50.88 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  31.76 
 
 
146 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  52.83 
 
 
132 aa  51.2  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 
144 aa  51.2  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  46.3 
 
 
192 aa  51.2  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  62.86 
 
 
218 aa  51.2  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  65.71 
 
 
136 aa  51.2  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  32.08 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 
158 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  49.12 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.83 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  37.35 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  61.11 
 
 
219 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  46.3 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 
144 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  49.12 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  36.23 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  31.76 
 
 
147 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  31.33 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  40.85 
 
 
132 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  39.68 
 
 
70 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  28.41 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  49.12 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  65.71 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  62.86 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  62.86 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  49.12 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  49.12 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>