More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1215 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  100 
 
 
347 aa  699    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  58.67 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  51.15 
 
 
347 aa  344  1e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  46.09 
 
 
346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  40.51 
 
 
358 aa  269  5e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  40.91 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  38.75 
 
 
358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  40.56 
 
 
359 aa  229  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  40.28 
 
 
359 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  37.5 
 
 
354 aa  226  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  39.72 
 
 
358 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.29 
 
 
352 aa  220  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
388 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
386 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
374 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
396 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
355 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
365 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  36.29 
 
 
383 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
363 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  31.25 
 
 
385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
371 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  28.3 
 
 
440 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
399 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
390 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
388 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
370 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  27 
 
 
366 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
443 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27 
 
 
366 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
890 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  27.56 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 
384 aa  96.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
384 aa  96.3  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
351 aa  96.3  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  26 
 
 
375 aa  94  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
350 aa  93.6  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2882  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
348 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
418 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
425 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
392 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  28.01 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.73 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  25.07 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
385 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.84 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  25.41 
 
 
416 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.59 
 
 
366 aa  88.6  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
384 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
392 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.81 
 
 
372 aa  86.7  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
689 aa  86.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
415 aa  86.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
362 aa  85.9  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
356 aa  85.9  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.04 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
669 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  35.53 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
381 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  34.42 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  31.28 
 
 
654 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
361 aa  82.4  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
409 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
660 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  28.96 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.24 
 
 
465 aa  80.9  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
762 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  31.79 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0440  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.438778  normal  0.0102055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
1264 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>