More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0765 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0647  prolyl-tRNA synthetase  70.9 
 
 
569 aa  854    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.785979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0765  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
567 aa  1157    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0150989  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1387  prolyl-tRNA synthetase  70.37 
 
 
569 aa  848    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1050  prolyl-tRNA synthetase  80.04 
 
 
566 aa  939    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000328969  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  68.2 
 
 
567 aa  812    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0897  prolyl-tRNA synthetase  68.89 
 
 
569 aa  833    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.365836  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0769  prolyl-tRNA synthetase  68.08 
 
 
565 aa  814    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0568  prolyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 
569 aa  852    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.418089  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0689  prolyl-tRNA synthetase  70.14 
 
 
567 aa  819    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
564 aa  534  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
576 aa  521  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
571 aa  519  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
571 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
576 aa  502  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
584 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
576 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
574 aa  497  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
569 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
580 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
585 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
574 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
572 aa  488  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
568 aa  485  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
572 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
568 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
572 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
573 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
572 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
579 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  45 
 
 
571 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
571 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
574 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
570 aa  488  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
572 aa  485  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
570 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
570 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
575 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
567 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
572 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
572 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
572 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
573 aa  478  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
572 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
572 aa  480  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
572 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
572 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  43.8 
 
 
572 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
569 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
572 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
572 aa  480  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
573 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
572 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
571 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
572 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
574 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
566 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
571 aa  475  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
566 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
566 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
572 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
571 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
573 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
572 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
572 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
572 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
578 aa  477  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
574 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
572 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
566 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
571 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
566 aa  475  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
566 aa  475  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
566 aa  475  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
566 aa  475  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
572 aa  472  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
576 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
572 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
573 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
566 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
578 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
570 aa  475  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
566 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
584 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  44 
 
 
574 aa  472  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
571 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
574 aa  472  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
571 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
574 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
571 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
574 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  44.39 
 
 
575 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
573 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
567 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
572 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
578 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>