More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0512 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0922  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  68.38 
 
 
527 aa  737    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0970  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  68.95 
 
 
527 aa  741    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1188  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  65.97 
 
 
526 aa  716    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0512  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
525 aa  1066    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0480  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  68.38 
 
 
525 aa  744    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1248  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  73.14 
 
 
525 aa  794    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0615  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  70.48 
 
 
528 aa  768    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0119419  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1569  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  87.05 
 
 
525 aa  944    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  68.95 
 
 
527 aa  743    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0875  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  59.08 
 
 
529 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0119441  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0786  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.78 
 
 
527 aa  382  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.61 
 
 
534 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.5 
 
 
526 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.11 
 
 
527 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.96 
 
 
532 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.55 
 
 
529 aa  372  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.11 
 
 
527 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.7 
 
 
530 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.09 
 
 
529 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.49 
 
 
531 aa  362  9e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.83 
 
 
528 aa  361  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.2 
 
 
529 aa  359  9e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.81 
 
 
529 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.42 
 
 
529 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.3 
 
 
527 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.51 
 
 
529 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.48 
 
 
529 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.15 
 
 
525 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.57 
 
 
531 aa  355  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.98 
 
 
523 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.81 
 
 
529 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.67 
 
 
529 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.92 
 
 
526 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.74 
 
 
525 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.38 
 
 
528 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966677  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2650  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.21 
 
 
528 aa  348  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.38 
 
 
524 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.5 
 
 
531 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.84 
 
 
527 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1543  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.4 
 
 
527 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00623773  hitchhiker  0.0000362163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.96 
 
 
531 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.95 
 
 
526 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.17 
 
 
531 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1737  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.42 
 
 
541 aa  340  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.88 
 
 
531 aa  340  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.92 
 
 
531 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1352  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.92 
 
 
534 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.86 
 
 
532 aa  335  9e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.4 
 
 
532 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.84 
 
 
529 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119542  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.38 
 
 
542 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.13 
 
 
531 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570425  hitchhiker  0.00544887 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.8 
 
 
529 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.89 
 
 
529 aa  334  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2680  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.99 
 
 
540 aa  333  4e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.38 
 
 
525 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.84 
 
 
526 aa  333  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.38 
 
 
525 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1961  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.86 
 
 
532 aa  333  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.829673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3115  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.96 
 
 
535 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00187643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2087  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.33 
 
 
535 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0521319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1423  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.26 
 
 
527 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.17 
 
 
528 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.04 
 
 
531 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.89 
 
 
528 aa  330  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.62 
 
 
525 aa  330  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1629  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.74 
 
 
533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.74 
 
 
533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.9 
 
 
529 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.38 
 
 
523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.95 
 
 
523 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.13 
 
 
541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.09 
 
 
529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.45 
 
 
528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.26 
 
 
523 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.13 
 
 
539 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1229  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.86 
 
 
533 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270378  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.26 
 
 
528 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.02 
 
 
529 aa  327  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2813  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.82 
 
 
532 aa  326  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1202  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.28 
 
 
528 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0614  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.28 
 
 
528 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11540  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.5 
 
 
527 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00507142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4467  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.03 
 
 
526 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0468875  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0710  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.76 
 
 
542 aa  323  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.196237  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.88 
 
 
523 aa  323  4e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.17 
 
 
531 aa  322  7e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0174  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.27 
 
 
529 aa  322  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996447  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.67 
 
 
531 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.21 
 
 
525 aa  322  9.000000000000001e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1288  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.05 
 
 
531 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.605181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1520  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.23 
 
 
526 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0002199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.43 
 
 
525 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.17 
 
 
652 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2827  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.99 
 
 
546 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3021  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.74 
 
 
531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1189  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.83 
 
 
535 aa  321  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15151  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.07 
 
 
528 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0896  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.19 
 
 
527 aa  320  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1018  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.19 
 
 
527 aa  320  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000612711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>