More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0305 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
294 aa  592  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.44 
 
 
293 aa  411  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.14 
 
 
291 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0322301 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.26 
 
 
287 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.01 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1760  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.33 
 
 
298 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0453677 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1998  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.36 
 
 
299 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000687148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.32 
 
 
292 aa  394  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.5 
 
 
289 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3186  glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase  64.71 
 
 
304 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.07 
 
 
296 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.23 
 
 
289 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.76 
 
 
290 aa  388  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.76 
 
 
290 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_002950  PG1563  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.85 
 
 
289 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 
296 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.76 
 
 
296 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0416  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  62.85 
 
 
292 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.07 
 
 
293 aa  384  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001807  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.24 
 
 
293 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.81 
 
 
292 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.89 
 
 
289 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3464  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.07 
 
 
293 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.63 
 
 
296 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3029  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.58 
 
 
291 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.54 
 
 
286 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1781  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
298 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000367124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  62.15 
 
 
295 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
288 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
290 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1914  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
298 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1894  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
292 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284713  normal  0.0266706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1402  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.28 
 
 
291 aa  381  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2829  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.23 
 
 
289 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4134  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.96 
 
 
293 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  62.15 
 
 
289 aa  382  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1380  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.54 
 
 
286 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.62 
 
 
292 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.96 
 
 
292 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0179  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  62.15 
 
 
294 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0244  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  62.15 
 
 
294 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.96 
 
 
292 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2896  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.89 
 
 
288 aa  378  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.257197 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1299  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
291 aa  377  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1449  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.34 
 
 
291 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1919  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.93 
 
 
298 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.48 
 
 
293 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.25 
 
 
294 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  60.27 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.25 
 
 
294 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0702  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.41 
 
 
307 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00504967  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.59 
 
 
293 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
292 aa  374  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3052  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.66 
 
 
298 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.664934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.42 
 
 
291 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000315653  normal  0.563962 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.59 
 
 
310 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
293 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
293 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.18 
 
 
290 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
293 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.59 
 
 
293 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.68 
 
 
292 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.25 
 
 
289 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.9 
 
 
294 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1473  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.07 
 
 
287 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.905305  normal  0.376761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.9 
 
 
294 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.59 
 
 
289 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.25 
 
 
294 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.53 
 
 
298 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.3 
 
 
292 aa  371  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.64 
 
 
289 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2131  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.38 
 
 
297 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2049  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.5 
 
 
300 aa  371  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635858  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1069  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.9 
 
 
296 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.69912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  56.85 
 
 
298 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.42 
 
 
289 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.53 
 
 
298 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.54 
 
 
292 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0455332  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.39 
 
 
296 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.56 
 
 
293 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.62 
 
 
295 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.42 
 
 
292 aa  368  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.52 
 
 
291 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
288 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2858  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.08 
 
 
289 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0450568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.59 
 
 
358 aa  368  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.34957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.07 
 
 
293 aa  368  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.28 
 
 
287 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.04 
 
 
294 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.27 
 
 
299 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.03 
 
 
293 aa  368  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.390759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4021  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.25 
 
 
289 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.9 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2240  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.23 
 
 
305 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>