More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1109 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  304  3e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  81.25 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  65.06 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  52.5 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  88.14 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  66.67 
 
 		 187 aa  101  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  64.29 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  37.96 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  44.16 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  45.45 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  47.22 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  34.17 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  66.67 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  51.67 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  63.27 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.84 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  55.1 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  66.67 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  46.55 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  71.05 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1480  transformation system protein  45.59 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.754405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  43.55 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  50 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  40.54 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  38.75 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.68 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  42.19 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  46.15 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  32.22 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  32.22 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  32.22 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  58.49 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  37.84 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  36.49 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  82.14 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.51 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  35.14 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  46.3 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  33.78 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  33.78 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.94 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  42.86 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  49.18 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  34.18 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  42.59 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.07 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  65.71 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.52 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  62.16 
 
 		 201 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  32.43 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  38.64 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  62.16 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  32.56 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  32.56 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  49.18 
 
 		 211 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  35.14 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  36.51 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  47.54 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  60.53 
 
 		 219 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  47.54 
 
 		 205 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  62.16 
 
 		 205 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  47.54 
 
 		 205 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  57.89 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.15 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.48 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  35.62 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  27.47 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.85 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  47.54 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  47.54 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  62.16 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  35.94 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  32.43 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  56.1 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  32.1 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  47.54 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  47.54 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>