36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0626 on replicon NC_009795
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  831    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  34.15 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  31.06 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  34.58 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  29.87 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  37.14 
 
 		 128 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  30.39 
 
 		 214 aa  53.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  28.83 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  31.03 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  24.26 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  30.33 
 
 		 341 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  28.28 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  32.08 
 
 		 272 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  38.89 
 
 		 497 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  35.24 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  27.87 
 
 		 877 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  26.77 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  30.84 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  51.52 
 
 		 339 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  29.35 
 
 		 140 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  27.27 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  25.88 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  28.24 
 
 		 212 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  25.77 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  29.59 
 
 		 225 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4327  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  26.15 
 
 		 280 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  27.69 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  41.82 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  28.85 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  26.23 
 
 		 341 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  23.17 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  25.83 
 
 		 230 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  30.53 
 
 		 197 aa  43.1  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  27.35 
 
 		 123 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>