125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09193 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  100 
 
 
560 aa  1144    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  24.95 
 
 
587 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  25.85 
 
 
633 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  23.93 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  28.18 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  24.82 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  26.63 
 
 
628 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  25.42 
 
 
669 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  26.38 
 
 
628 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  26.92 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  26.85 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  24.18 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  25.31 
 
 
639 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  24.94 
 
 
641 aa  77.8  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  29.25 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 
658 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  29.46 
 
 
626 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  24.63 
 
 
638 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  25.59 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  25.53 
 
 
694 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  23.74 
 
 
647 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  25.67 
 
 
718 aa  73.9  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  27.3 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  23.65 
 
 
708 aa  73.9  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  27.19 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  31 
 
 
631 aa  73.6  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  26.32 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  24.85 
 
 
640 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  29.92 
 
 
624 aa  72.4  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  23.34 
 
 
687 aa  71.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  24.12 
 
 
647 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  24.63 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  24.81 
 
 
663 aa  70.5  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  24.94 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  23.57 
 
 
461 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  26.95 
 
 
372 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  26.13 
 
 
629 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  26.32 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  23.72 
 
 
624 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  24.44 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  24.4 
 
 
476 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  23.94 
 
 
704 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  26.49 
 
 
484 aa  67  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  21.68 
 
 
739 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  25 
 
 
674 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  25.8 
 
 
681 aa  66.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  25.31 
 
 
651 aa  65.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  26.58 
 
 
663 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  23.54 
 
 
689 aa  64.7  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  27.94 
 
 
612 aa  63.9  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  24.15 
 
 
696 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  24.08 
 
 
715 aa  62  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  22.36 
 
 
680 aa  62  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  24.81 
 
 
689 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  24.37 
 
 
694 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  21.48 
 
 
642 aa  61.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  23.47 
 
 
663 aa  61.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  27.13 
 
 
695 aa  60.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  23.48 
 
 
471 aa  60.5  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  29.09 
 
 
504 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  24.61 
 
 
667 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  23.56 
 
 
634 aa  60.1  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  21.39 
 
 
698 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  24.3 
 
 
821 aa  57.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  27.53 
 
 
702 aa  57.4  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  23.47 
 
 
642 aa  57.4  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  24.76 
 
 
674 aa  57  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  26.97 
 
 
688 aa  57  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  23.53 
 
 
702 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  25.51 
 
 
662 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  25.55 
 
 
462 aa  54.3  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  30.22 
 
 
786 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  30.34 
 
 
458 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  25.06 
 
 
690 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  22.22 
 
 
593 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  26.14 
 
 
708 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  23.96 
 
 
672 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  24.56 
 
 
667 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  24.82 
 
 
691 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  23.7 
 
 
672 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  24.93 
 
 
687 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  31.39 
 
 
659 aa  50.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  23.26 
 
 
699 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  23.26 
 
 
699 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  23.26 
 
 
699 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12193  hypothetical protein  35.62 
 
 
509 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  23.65 
 
 
691 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  25 
 
 
442 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  25.86 
 
 
625 aa  49.3  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  23.58 
 
 
593 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  28.08 
 
 
596 aa  48.5  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  22.52 
 
 
631 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  36.9 
 
 
984 aa  48.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3179  protein of unknown function DUF839  29.45 
 
 
818 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  29.93 
 
 
677 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  32.61 
 
 
887 aa  48.1  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4941  protein of unknown function DUF839  28.97 
 
 
751 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  36.56 
 
 
1093 aa  47.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  30.66 
 
 
659 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  22.98 
 
 
689 aa  47.4  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>