More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06970 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  231  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  48.78 
 
 
126 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  48.78 
 
 
126 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  45.6 
 
 
133 aa  90.1  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  47.22 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  44.26 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
128 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  41.46 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  42.4 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  41.13 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 
127 aa  77  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  43.2 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  45.74 
 
 
127 aa  76.6  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  40.87 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40.16 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.47 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  45.28 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  39.84 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  44.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  40.5 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  38.26 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  41.03 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.52 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  39.78 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
131 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.52 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  34.68 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  42.28 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  41.67 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  34.71 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  35.4 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  37.3 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  40.83 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.46 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  45.08 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0818  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  40.34 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  40.83 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  41.49 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  37.29 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  34.4 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  41.8 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  38.52 
 
 
122 aa  67  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  37.7 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  36.8 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  40.8 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  41.67 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  39.5 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  37.8 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  32.8 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  37.74 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  32.8 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  40.66 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  30.58 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  37.37 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>