More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05420 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 311 aa  639    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  79.42 
 
 		 326 aa  516  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  79.42 
 
 		 325 aa  512  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  63.99 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  62.7 
 
 		 324 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  61.17 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2276  octaprenyl-diphosphate synthase  62.06 
 
 		 326 aa  371  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0545  Trans-hexaprenyltranstransferase  59.09 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112091 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  48.08 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  48.55 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  45.19 
 
 		 324 aa  298  9e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  46.15 
 
 		 324 aa  295  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  46.15 
 
 		 324 aa  295  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  45.31 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  44.55 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  44.23 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  38.18 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  38.02 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.78 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.51 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  38.33 
 
 		 292 aa  216  5e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  37.38 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  36.66 
 
 		 334 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  35.86 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  35.53 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.08 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  37.09 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  37.09 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  34.44 
 
 		 345 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  34.82 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34 
 
 		 322 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  33.99 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  33.99 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  34.54 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  36.16 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  31.51 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  32.69 
 
 		 336 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  33.01 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  32.78 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  32.69 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  34.5 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  33.66 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  31.19 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  32.78 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  36.51 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  34.85 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  31.77 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  34.54 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  34.3 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  31.56 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  31.73 
 
 		 336 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  30.56 
 
 		 339 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  34.29 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  34.98 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  35.05 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  32.91 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3665  trans-hexaprenyltranstransferase  37.06 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000484392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1139  octaprenyl-diphosphate synthase  36.42 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  33.44 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  31.41 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  34.3 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  31.35 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524  octaprenyl-diphosphate synthase  36.1 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0921642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1306  octaprenyl-diphosphate synthase  36.1 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3257  octaprenyl-diphosphate synthase  36.1 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  32.59 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0447  octaprenyl-diphosphate synthase  36.1 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3491  octaprenyl-diphosphate synthase  36.1 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.12 
 
 		 324 aa  185  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0550  polyprenyl synthetase  37.06 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400591  normal  0.0346751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  32 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0098  trans-hexaprenyltranstransferase  37.06 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0580  trans-hexaprenyltranstransferase  37.06 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478477  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2803  polyprenyl synthetase  36.74 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000673013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3524  octaprenyl-diphosphate synthase  36.1 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  35.9 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0508  polyprenyl synthetase  36.74 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000945867  normal  0.644632 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  32.89 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  36.1 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0483  trans-hexaprenyltranstransferase  36.74 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000223454  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  31.83 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  34.74 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  31.77 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  32.37 
 
 		 323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  32.46 
 
 		 345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  30.87 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  31.09 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  32.78 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>