41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04405 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  956    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04415  hypothetical protein  69.38 
 
 
424 aa  546  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  48.39 
 
 
501 aa  423  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  36.71 
 
 
538 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07181  conserved hypothetical protein  41.24 
 
 
452 aa  290  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882964  normal  0.428749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1229  PKD domain-containing protein  37.13 
 
 
675 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.97 
 
 
911 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.2 
 
 
913 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1588  HAD family hydrolase  32.17 
 
 
835 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570612  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  25.44 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  22.56 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  23.13 
 
 
470 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.67 
 
 
665 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  23.16 
 
 
645 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  36.23 
 
 
1031 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04105  hypothetical protein  33.75 
 
 
349 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  38.46 
 
 
657 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_002950  PG2102  immunoreactive 61 kDa antigen PG91  34.21 
 
 
540 aa  50.1  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  38.16 
 
 
927 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0411  hemagglutinin, putative  29.55 
 
 
925 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  32.26 
 
 
1441 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  34.48 
 
 
416 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2100  immunoreactive 63 kDa antigen PG102  32.93 
 
 
554 aa  47.8  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.586482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  28.36 
 
 
1437 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  39.47 
 
 
827 aa  47.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  36.84 
 
 
669 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  26.92 
 
 
937 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3049  hypothetical protein  23.33 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  30.34 
 
 
2239 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  27.27 
 
 
843 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  33.33 
 
 
1118 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  33.85 
 
 
654 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  22.06 
 
 
480 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  43.06 
 
 
112 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  27.63 
 
 
356 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  32.79 
 
 
617 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  35.62 
 
 
365 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  23.19 
 
 
882 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3958  Fibronectin type III domain protein  34.48 
 
 
662 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44446  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  34.15 
 
 
1093 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09933  hypothetical protein  33.33 
 
 
349 aa  43.5  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>